Diakonia är fem svenska kyrkors gemensamma biståndsorgan. De fem kyrkorna är Alliansmissionen, Baptistsamfundet, Evangeliska Frikyrkan, Metodistkyrkan och Missionskyrkan.

Diakonias representantskap fattar beslut av övergripande karaktär och utser styrelseledamöter samt fastställer de ekonomiska ramarna. Representantskapet består av ombud från huvudmännen. De utser även Diakonias generalsekreterare och styrelse.

Styrelse och generalsekreterare

Styrelsen, som utses av representantskapet, är ytterst ansvarig för Diakonias verksamhet.

Generalsekreteraren är Diakonias högsta chef. En viktig uppgift för generalsekreteraren är att företräda Diakonia i olika sammanhang samt att se till att verksamheten följer fastställda riktlinjer och beslut. 

Huvudkontor

Diakonias huvudkontor är beläget i Stockholm (Sundbyberg). Personalen på huvudkontoret arbetar bland annat med insamling, folkbildning, information, opinionsbildning och administration. Här arbetar också personer med ansvar för specifika teman eller samordning av arbetet i de länder där Diakonia och våra partnerorganisationer verkar.

Region- och landkontor

Internationellt har Diakonia ett antal regionkontor och dessutom lokala landkontor. Det är utanför Sverige som vi har största delen avvår personal (oftast lokalanställda). Från våra region- och landkontor sköts det konkreta samarbetet med våra 400 samarbetsorganisationer, som finns i drygt 30 länder. Kontoren ansvarar också för uppföljningar av arbetet.